對補充水的水質應根據要求，區別情況。可由全廠統一供應自來水或軟化水，也可以在站內單獨設置水處理裝置。

如果用戶使用不合格的冷卻水，就會因污垢的積聚使制冷機制冷量下降，功耗增加，甚至由于冷凝壓力過高而不能運行。

另外，還會產生腐蝕而縮短制冷機的使用壽命。

冷卻水水質處理的主要措施有以下幾個方面：

1.阻垢措施

對于結垢的循環冷卻水常用的阻垢方法的排污法、酸化法、軟化法及投加阻垢劑等。

排污法適用于水質的碳酸硬度較低且水量少或水源豐富的地區。

當補充水的碳酸鹽硬度較大時，可采用加酸措施，控制PH值在7.2~7.8范圍內。

軟化法可采用離子交換軟化與加藥沉淀軟化

2.腐蝕控制

對腐蝕性循環冷卻水可采用阻垢緩蝕劑進行處理，以達到緩蝕阻垢的目的。

3.微生物污染的控制

在冷卻塔和水池里會存在大量的微生物，如細菌、真菌和藻類等，其危害性很大。因此，應對冷卻水進行殺菌、滅藻處理。

微生物污染的控制的主要途經有防曬、旁濾、前處理和投加殺蟲劑等。

防曬法是在開式水池上部加蓋，避免陽光照射。

旁濾法是部分水經過旁濾池過濾，除去濁類、藻類。

前處理是在補給水前進行處理，除去懸浮物和部分浮游生物及細菌。

還可向水中投加殺蟲劑液氯、次氯酸鈉、二氧化氯等殺滅各種微生物。

為防止雜物混入制冷機組的冷卻水系統，在冷卻塔的冷卻水系統中必須加裝水過濾器。